143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3221 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 413 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3225  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  74.32 
 
 		 416 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3219  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  70.68 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  27.71 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2046  hypothetical protein  30.24 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.621675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  27.59 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  28.82 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5580  hypothetical protein  28.71 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2025  hypothetical protein  26.59 
 
 		 422 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0203629  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7028  hypothetical protein  25.36 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  26.29 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  26.21 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  26.27 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26.28 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26.28 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  25 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  26.5 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26.37 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  27.18 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2955  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.84 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0324512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0462  hypothetical protein  25.16 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  24.94 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3675  hypothetical protein  23.54 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3676  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.23 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  23.23 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0519  hypothetical protein  24.93 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3271  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  24.53 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3119  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  23.2 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3169  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  24.23 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  28.89 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  31.97 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  31.97 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  22.36 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  24.6 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  41.76 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1979  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.43 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6234  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  24.75 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.33 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4018  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  23.66 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  29.51 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8308  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.64 
 
 		 561 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  29.51 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.57 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.47 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  24.81 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  28.71 
 
 		 382 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.81 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  23.24 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6824  hypothetical protein  22.9 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.759789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.17 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  24.43 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  22.63 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>