146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0606 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 404 aa  815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2955  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  61.1 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0324512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0462  hypothetical protein  64.27 
 
 		 405 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  60.31 
 
 		 406 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3271  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  55.2 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3169  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  56.84 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0519  hypothetical protein  56.4 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3119  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  55.05 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6824  hypothetical protein  56.72 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.759789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  52.48 
 
 		 403 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  52.63 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6234  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  55.83 
 
 		 402 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2700  hypothetical protein  54.35 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  50.26 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  36.75 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3675  hypothetical protein  34.81 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  36.07 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  35.79 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3002  hypothetical protein  35.34 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  35.17 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5580  hypothetical protein  36.2 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2046  hypothetical protein  35.19 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.621675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  36.04 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7028  hypothetical protein  32.85 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2025  hypothetical protein  35.68 
 
 		 422 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0203629  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6809  hypothetical protein  65.42 
 
 		 180 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3895  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  37.78 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926603  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4368  hypothetical protein  45.1 
 
 		 117 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3676  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.47 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3219  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.24 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  26.22 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1979  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.98 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  25.45 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.99 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  23.72 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3225  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.59 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  31.46 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  23.46 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0595  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  49.23 
 
 		 82 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4735  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.5 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.96581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  29.17 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8308  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.16 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.64 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3347  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  23.35 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.862215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  28.57 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.98 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26.17 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  22.32 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3866  hypothetical protein  24.44 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  33.02 
 
 		 559 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  23.6 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  23.15 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  29.12 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  22.42 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2285  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.99 
 
 		 559 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  31.91 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  27.15 
 
 		 399 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0270  hypothetical protein  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3289  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1838  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0057  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0056  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2714  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.98 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.395305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  21.86 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.92 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.07 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  33.65 
 
 		 558 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4018  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  21.48 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3633  Extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>