More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3895 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3895  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  100 
 
 		 322 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926603  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3675  hypothetical protein  46.88 
 
 		 408 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  38.59 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  37.24 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  36.1 
 
 		 417 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6234  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  36.17 
 
 		 402 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3119  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  34.87 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0462  hypothetical protein  33.19 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2700  hypothetical protein  35.59 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3271  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  33.75 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  35 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  35 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  34.96 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5580  hypothetical protein  36.05 
 
 		 454 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3169  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  33.76 
 
 		 402 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0519  hypothetical protein  34.62 
 
 		 418 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  37.78 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3002  hypothetical protein  33.76 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  37.1 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6824  hypothetical protein  33.76 
 
 		 401 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.759789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2955  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  29.57 
 
 		 403 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0324512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7028  hypothetical protein  34.71 
 
 		 419 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2046  hypothetical protein  34.85 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.621675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2025  hypothetical protein  35.15 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0203629  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  31.42 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4368  hypothetical protein  41.38 
 
 		 117 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6809  hypothetical protein  39.39 
 
 		 180 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0595  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  46.84 
 
 		 82 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.795083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.45 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  43.94 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  40 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.91 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  34.15 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.43 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  43.75 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  45.61 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  35.82 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  38.57 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  29.5 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.450769  normal  0.344502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  42.42 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  38.33 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.94 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.44 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.94 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.11 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>