28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8308 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8308  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 561 aa  1118    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4018  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  42.39 
 
 		 481 aa  345  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3866  hypothetical protein  25.06 
 
 		 464 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3490  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.55 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  25.13 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  26.03 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  24.37 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0519  hypothetical protein  26.79 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3676  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.98 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  31.34 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 385 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3245  putative branched-chain amino acid ABC transport system, solute-binding protein  24.43 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 385 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  26.52 
 
 		 425 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  31.06 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  21.02 
 
 		 386 aa  50.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.64 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  24.9 
 
 		 541 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  28.57 
 
 		 438 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  21.75 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  25.7 
 
 		 383 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  21.99 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  21.84 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 		 377 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.47 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6824  hypothetical protein  29.52 
 
 		 401 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.759789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>