More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3027 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 
440 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  70.53 
 
 
421 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  61.19 
 
 
420 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  59.6 
 
 
423 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  57.22 
 
 
434 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  38.99 
 
 
416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.04 
 
 
440 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
392 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 
388 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.49 
 
 
440 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
387 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  28.67 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 
387 aa  87  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.4 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  24.33 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  25.07 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.5 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  24.04 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.38 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.16 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  22.68 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  23.75 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.02 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  24.78 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  26 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  24.73 
 
 
404 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.87 
 
 
420 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  22.04 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  24.72 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  25.59 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.38 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
382 aa  65.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.67 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.71 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
407 aa  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
472 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
419 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 
372 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
393 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  24.32 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  22.96 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 
376 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.61 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>