47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1831 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  84.32 
 
 		 440 aa  712    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 440 aa  900    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.81 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.99 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.46 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  30.18 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.13 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.91 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  23.02 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.96 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  22.98 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  24.5 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  23.53 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4713  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  38.2 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.82 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  24.7 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  23.65 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  27.95 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>