28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1830 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  84.32 
 
 		 440 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 440 aa  902    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.38 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 421 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.77 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.32 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.69 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.8 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 407 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.35 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  21.95 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  24.3 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4713  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  38.2 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  22.94 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  24.31 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>