More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0756 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 
420 aa  846    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  61.19 
 
 
440 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  60.1 
 
 
421 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  55.53 
 
 
423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  53.05 
 
 
434 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  39.94 
 
 
416 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 
390 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.49 
 
 
440 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 
398 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  28.54 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  28.54 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
387 aa  90.1  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
382 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
385 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 
423 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  29.35 
 
 
438 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.37 
 
 
440 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  26.92 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  27.8 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
472 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  27.67 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
392 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  27.35 
 
 
480 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0404  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  24.85 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.28 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.65 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  23.91 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0801  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  25.37 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.0350726 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  27.73 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  23.86 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  24.66 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.37 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.81 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  24.7 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0029  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  25.45 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.81 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  30.36 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  24.94 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  25.53 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 
394 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  24.17 
 
 
400 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>