More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3166 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 
423 aa  862    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  59.14 
 
 
421 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  59.6 
 
 
440 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  55.53 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  50.13 
 
 
434 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  39.35 
 
 
416 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.81 
 
 
440 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.25 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
407 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
390 aa  99.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.3 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
394 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  26.76 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.78 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  25 
 
 
480 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.73 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  25.07 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.35 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.1 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.02 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  23.39 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  34.35 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.43 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.6 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.23 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.8 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.49 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  29.69 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  25.53 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  22.01 
 
 
394 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1027  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000299575  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  22.79 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  23.14 
 
 
539 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.36 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.55 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
375 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  24.62 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
385 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 
409 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  23.38 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 
370 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  26.63 
 
 
438 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
397 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  22.43 
 
 
496 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  20.37 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  24.4 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>