23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3829 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 416 aa  825    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  38.75 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 421 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  38.93 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.4 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  38.97 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.87 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.54 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  22.59 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.53 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.01 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>