More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4681 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 
434 aa  864    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  59.32 
 
 
421 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  55.67 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  53.05 
 
 
420 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.12 
 
 
423 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3829  putative branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein  39.4 
 
 
416 aa  236  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1831  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28 
 
 
440 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
394 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1830  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.8 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0495753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
388 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
392 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.5 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.1 
 
 
403 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  29.06 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.66 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  27.45 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.07 
 
 
420 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.9 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  24.58 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.32 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  23.2 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  22.98 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.78 
 
 
380 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 
390 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  23.41 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2445  Extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  26.57 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
541 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  23.17 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0404  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  22.97 
 
 
438 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.62 
 
 
374 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  26.14 
 
 
418 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
379 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.4 
 
 
512 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.29 
 
 
396 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  38.71 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  21.1 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  27.59 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.45 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
370 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
381 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
386 aa  60.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
410 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  21.94 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  25.11 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.61 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  22.6 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
371 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  20.99 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  23.51 
 
 
373 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  22.72 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>