223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2714 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  100 
 
 
419 aa  862    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0270  hypothetical protein  99.76 
 
 
419 aa  861    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  96.42 
 
 
419 aa  836    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3289  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
419 aa  862    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1838  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
419 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0057  putative ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 
419 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0056  putative ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 
419 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2714  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
419 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.395305  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  59.22 
 
 
417 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1173  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.02 
 
 
393 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.760963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1076  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.74 
 
 
393 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2537  hypothetical protein  29.68 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00283871  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7508  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.61 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0612  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 
400 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  42.72 
 
 
451 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  28.3 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
407 aa  63.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  23.51 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 
386 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  41.67 
 
 
447 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
403 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  36.52 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0462  hypothetical protein  26.23 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.07 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  24.46 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.94 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  33.66 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  40.45 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  38.89 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  23.39 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  39.24 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 
417 aa  57  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 
437 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  34.62 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  37.97 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  39.47 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  38.89 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  31.93 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  32.73 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  38.6 
 
 
407 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  39.73 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1842  hypothetical protein  30.89 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  22.13 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  23.79 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0801  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  29.63 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.0350726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
441 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  39.47 
 
 
380 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  34.74 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 
373 aa  53.5  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.12 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  35.87 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
407 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.15 
 
 
425 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
379 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  34.34 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  24.04 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  23.72 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  22.98 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  34.55 
 
 
448 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  39.44 
 
 
409 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  36.47 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  30.77 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  33.96 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  35.37 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  31.58 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4474  hypothetical protein  21.02 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
383 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.85 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  23.18 
 
 
394 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  34.04 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 
397 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  33.78 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  33.66 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  33.78 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>