More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3876 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3876  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 392 aa  787    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4267  extracellular ligand-binding receptor  85.71 
 
 		 392 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.76 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  21.76 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  22.93 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.95 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.22 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  20.44 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  23.64 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.16 
 
 		 389 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.07 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  22.61 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.79 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  23.32 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.52 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.22 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  22.82 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  22.93 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.59 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.4 
 
 		 410 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  22.72 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.33 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.46 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  25.55 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  22.08 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 473 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 473 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.16 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  21.21 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>