243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0488 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0488  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 556 aa  1098    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4083  Tetratricopeptide domain protein  36.48 
 
 		 571 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.446531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2012  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0246566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4061  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.04 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000018866  hitchhiker  0.000000049947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5093  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 590 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4799  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 563 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7021  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 571 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 1737 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 265 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1676 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 878 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.36 
 
 		 863 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.5 
 
 		 764 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 		 3301 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.77 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1297 aa  57.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.71 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 718 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.01 
 
 		 729 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.39 
 
 		 2240 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.64 
 
 		 707 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 265 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.87 
 
 		 746 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.82 
 
 		 875 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 3172 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.76 
 
 		 1979 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 313 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 2262 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 634 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.18 
 
 		 725 aa  53.9  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 		 550 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.25 
 
 		 887 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.4 
 
 		 626 aa  53.9  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 1371 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.66 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 632 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 581 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  33.68 
 
 		 174 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  24.29 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1094 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.67 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 1154 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  23.67 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 243 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 562 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 543 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.43 
 
 		 676 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 209 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 		 593 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 927 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 3035 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 248 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 573 aa  50.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.54 
 
 		 587 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 713 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 594 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 968 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 293 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 		 449 aa  50.4  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 450 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.54 
 
 		 1022 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 213 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 750 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.63 
 
 		 730 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 2262 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  22.27 
 
 		 635 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 		 818 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.98 
 
 		 725 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 884 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.8 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 833 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  28.33 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 234 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.29 
 
 		 988 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>