56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4799 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4799  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 563 aa  1144    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5093  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 590 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4061  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 586 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000018866  hitchhiker  0.000000049947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4083  Tetratricopeptide domain protein  29.26 
 
 		 571 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.446531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2012  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 489 aa  120  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0246566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0488  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7021  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 		 571 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 		 1486 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 320 aa  53.9  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 245 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.67 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 448 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 591 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 265 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 1056 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 		 758 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  24.12 
 
 		 917 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 		 833 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 3172 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 3145 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 687 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6434  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 230 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  0.680724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 297 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5958  Tetratricopeptide TPR_4  27.45 
 
 		 2620 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  23.42 
 
 		 1006 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 766 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.57 
 
 		 681 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  26.82 
 
 		 765 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.36 
 
 		 267 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.25 
 
 		 818 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.25 
 
 		 784 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 		 988 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.07 
 
 		 887 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 265 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 789 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.67 
 
 		 832 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 1737 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  21.54 
 
 		 369 aa  44.3  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.03 
 
 		 707 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 265 aa  43.9  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 291 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 402 aa  43.9  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.02 
 
 		 557 aa  43.5  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 405 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.37 
 
 		 265 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  26.61 
 
 		 569 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.13 
 
 		 882 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>