128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2012 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2012  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 489 aa  987    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0246566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4083  Tetratricopeptide domain protein  29.09 
 
 		 571 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.446531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0488  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4061  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000018866  hitchhiker  0.000000049947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5093  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 		 590 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4799  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 563 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 		 1737 aa  94  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7021  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 571 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.24 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.2 
 
 		 1056 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 878 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.44 
 
 		 1056 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.36 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 		 784 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.73 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 673 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 750 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 808 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.67 
 
 		 988 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 		 1022 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 758 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.02 
 
 		 2240 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.42 
 
 		 1154 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  20.39 
 
 		 321 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 602 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 565 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 3172 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  20.27 
 
 		 4079 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 392 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 643 aa  53.5  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.41 
 
 		 573 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.27 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.83 
 
 		 3301 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 		 979 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  19.53 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.28 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 		 833 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  18.21 
 
 		 1069 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 352 aa  51.2  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.05 
 
 		 1979 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.57 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 567 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  19.95 
 
 		 486 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.6 
 
 		 639 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 3145 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.01 
 
 		 887 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 543 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.02 
 
 		 778 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  23.12 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 597 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.27 
 
 		 820 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.96 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  18.33 
 
 		 1406 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  19.71 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 621 aa  49.3  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1161 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 621 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  28.99 
 
 		 612 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  27.12 
 
 		 638 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  21.05 
 
 		 929 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.49 
 
 		 733 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 1371 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 649 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.71 
 
 		 746 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1676 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  19.33 
 
 		 1178 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1297 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06138  Protein bimA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17885]  25.97 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.112787  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.85 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.04 
 
 		 643 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  22.6 
 
 		 936 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>