198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09693 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  979    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  46.14 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  40.85 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  32.69 
 
 		 494 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  32.01 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  32.15 
 
 		 494 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  29.46 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  31.95 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  31.08 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  27.97 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  29.33 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  28.69 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  30.55 
 
 		 530 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  30.3 
 
 		 566 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  32.18 
 
 		 555 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  27.64 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  28.54 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  29.32 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.55 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  31.09 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  28.08 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  30.14 
 
 		 522 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  30.12 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  30.75 
 
 		 538 aa  97.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  31.12 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.39 
 
 		 527 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  23.24 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  25.78 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  23.4 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  25.66 
 
 		 564 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.58 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.52 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  25.5 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25.75 
 
 		 401 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.11 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  22.99 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 711 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  26.41 
 
 		 428 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  23.93 
 
 		 544 aa  53.5  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  28.4 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  25.5 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  29.75 
 
 		 1024 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.93 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  26.75 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  24.05 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.53 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.65 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  22.69 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  28.81 
 
 		 707 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  21.85 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  26.22 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 		 674 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  26.22 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  27.74 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  23.75 
 
 		 445 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  23.42 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  24.63 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  24.63 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 		 394 aa  50.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  24.64 
 
 		 719 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 401 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  23.12 
 
 		 457 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 401 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  21.43 
 
 		 563 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  23.57 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  24.68 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  23.63 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  26.76 
 
 		 557 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  24.13 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  22.26 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.43 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  24.36 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  24.38 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  26.25 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  22.68 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0003  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 702 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  23.16 
 
 		 545 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  24.68 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>