125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0592 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  100 
 
 		 529 aa  1087    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  67.98 
 
 		 522 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  65.55 
 
 		 538 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  65.16 
 
 		 533 aa  715    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  52.66 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  48.28 
 
 		 555 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  47.74 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  47.75 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  42.44 
 
 		 530 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  38.8 
 
 		 566 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  42.27 
 
 		 530 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  38.81 
 
 		 440 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  28.1 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  30.79 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  29.28 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  28.89 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  28.74 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  26.91 
 
 		 492 aa  97.4  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  31.12 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  27.98 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  28.24 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  27.64 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  28.16 
 
 		 527 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  27.27 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  25.11 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  23.61 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.11 
 
 		 431 aa  67  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  27.43 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  29.24 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  27.83 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  32.17 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  28.74 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.67 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 429 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  25.99 
 
 		 457 aa  57  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  24.22 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  27.36 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 		 457 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  31.3 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 		 438 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 446 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  29.71 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  26.98 
 
 		 401 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 484 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  28.4 
 
 		 429 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  29.02 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.93 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  28.72 
 
 		 450 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 560 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 		 1081 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.08 
 
 		 483 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25.93 
 
 		 401 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  27.6 
 
 		 402 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  27.15 
 
 		 476 aa  50.4  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  26.79 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.03 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  22.41 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  24.57 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.85 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  27.44 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  27.34 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  23.86 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  27.07 
 
 		 710 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 494 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 		 413 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 		 413 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.24 
 
 		 440 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 		 449 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  23.65 
 
 		 444 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  27.94 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.2 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  26.67 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  27.75 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  29.58 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  31.07 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  28.04 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  25.44 
 
 		 1072 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.62 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  24.66 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>