196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003677 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 530 aa  1098    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  60.98 
 
 		 566 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  46.79 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  44.11 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  41.68 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  41.48 
 
 		 530 aa  360  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  39.96 
 
 		 533 aa  352  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  39.05 
 
 		 507 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  40.95 
 
 		 522 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  38.91 
 
 		 538 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  38.08 
 
 		 530 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  31.94 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  29.11 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  26.16 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  28.42 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.08 
 
 		 496 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  28.48 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  27.06 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  28.94 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  28.12 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  27.67 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  25 
 
 		 406 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  26.71 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  25.13 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.49 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  24.17 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  27.53 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  24.07 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  27.34 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.94 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  25.96 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  25.6 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  26.3 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 1081 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 		 394 aa  57  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 440 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.88 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 1024 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  25.6 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  25.33 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  25.08 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  26.81 
 
 		 842 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  23.25 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 379 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  26.84 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.54 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  23.7 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25.26 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.12 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 535 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  24.07 
 
 		 566 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 401 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  22.87 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 401 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 436 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  27.39 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 		 401 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  24.71 
 
 		 433 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 426 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  22.84 
 
 		 547 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  26.67 
 
 		 532 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  26.57 
 
 		 526 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 545 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 522 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 555 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  27.16 
 
 		 429 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  26.59 
 
 		 401 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  22.63 
 
 		 407 aa  50.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 550 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  25.18 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  29.2 
 
 		 482 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  25.31 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  25.54 
 
 		 572 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  24.11 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  23.37 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>