110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2716 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  66.08 
 
 		 529 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  100 
 
 		 522 aa  1073    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  69.77 
 
 		 538 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  71.11 
 
 		 533 aa  791    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  52.95 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  47.72 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  50.47 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  48.34 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  40.04 
 
 		 566 aa  334  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  43.11 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  40.95 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  38.26 
 
 		 440 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.57 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.7 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  29.32 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  28.04 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  26.05 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  29.49 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.55 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  29.44 
 
 		 481 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  29.6 
 
 		 527 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  27.12 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  27.65 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  25.61 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  24.56 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  27.01 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  28.17 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  28.17 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  28.25 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  23.21 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.12 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 431 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  29.14 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  29.8 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  27 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  29.08 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  30.61 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.43 
 
 		 453 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  29.34 
 
 		 444 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  23.84 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  22.38 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.86 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.84 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  26.37 
 
 		 444 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  22.53 
 
 		 483 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  28.16 
 
 		 425 aa  51.2  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  22.6 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2995  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.59 
 
 		 160 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0325839  normal  0.0185812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  25.6 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 		 457 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  27.74 
 
 		 383 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  25 
 
 		 540 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  28.02 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  23.56 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  25 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.65 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  23.9 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  29.86 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  24.42 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  25.13 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  25.41 
 
 		 457 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  23.3 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  29.76 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  24.69 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.65 
 
 		 401 aa  47  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  25.13 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  27.67 
 
 		 1081 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.07 
 
 		 426 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  24.73 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  30.66 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.73 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  28.72 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  22.59 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.68 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  26.67 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  25.3 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  28.09 
 
 		 401 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 507 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 416 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  26.71 
 
 		 554 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  30.54 
 
 		 470 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 569 aa  44.3  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>