More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2995 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2995  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0325839  normal  0.0185812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  46.67 
 
 		 511 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  37.08 
 
 		 526 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  37.08 
 
 		 523 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  44.59 
 
 		 495 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  36.05 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  44.74 
 
 		 491 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  42.67 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  39.71 
 
 		 385 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  44.59 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  44.59 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  44.59 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  44.59 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  44.59 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  33.71 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  41.67 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  44.59 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  44.59 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  48.44 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  37.18 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  35.96 
 
 		 528 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  37.08 
 
 		 516 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  43.42 
 
 		 502 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  35.14 
 
 		 413 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  42.47 
 
 		 494 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  42.47 
 
 		 494 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  42.47 
 
 		 494 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  35.14 
 
 		 412 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4524  PDZ/DHR/GLGF  40 
 
 		 348 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  42.47 
 
 		 493 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  42.47 
 
 		 494 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.5 
 
 		 453 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  42.47 
 
 		 493 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  39.44 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  42.47 
 
 		 493 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  35.96 
 
 		 527 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  35.71 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  35.71 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  38.96 
 
 		 489 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  34.07 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  34.18 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  30.21 
 
 		 498 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  38.96 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3543  2-alkenal reductase  35.96 
 
 		 577 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  40.28 
 
 		 392 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.95 
 
 		 511 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  32.98 
 
 		 520 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  35.11 
 
 		 496 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  35.11 
 
 		 496 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  36.11 
 
 		 528 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  35 
 
 		 506 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  30.14 
 
 		 376 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.07 
 
 		 386 aa  53.9  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  34.69 
 
 		 501 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  32.58 
 
 		 380 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  33.33 
 
 		 474 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.67 
 
 		 502 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  41.18 
 
 		 473 aa  53.9  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  37.66 
 
 		 512 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  40.98 
 
 		 425 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  37.5 
 
 		 383 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  31.51 
 
 		 376 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  36.71 
 
 		 498 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  34.83 
 
 		 523 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  35.11 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  40 
 
 		 457 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  31.87 
 
 		 537 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  35.53 
 
 		 522 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  30.14 
 
 		 376 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  37.84 
 
 		 406 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  36.71 
 
 		 499 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  34.09 
 
 		 513 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  36.26 
 
 		 502 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  37.14 
 
 		 492 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  35.14 
 
 		 501 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  39.71 
 
 		 517 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  37.14 
 
 		 492 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.85 
 
 		 499 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.78 
 
 		 408 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.03 
 
 		 511 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  35.85 
 
 		 403 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  43.59 
 
 		 522 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  34.29 
 
 		 458 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  33.78 
 
 		 496 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  35.11 
 
 		 504 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  29.73 
 
 		 354 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  35.53 
 
 		 511 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.94 
 
 		 474 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  40.58 
 
 		 511 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  34.04 
 
 		 503 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  34.04 
 
 		 503 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  36.11 
 
 		 415 aa  50.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.55 
 
 		 471 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  40.58 
 
 		 511 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  43.33 
 
 		 597 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  39.71 
 
 		 450 aa  50.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  30.67 
 
 		 473 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  30.77 
 
 		 407 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  35.14 
 
 		 497 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  36 
 
 		 419 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>