More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3543 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3543  2-alkenal reductase  100 
 
 		 577 aa  1163    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1346  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.67 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.24 
 
 		 392 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  34.24 
 
 		 385 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.69 
 
 		 389 aa  200  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  36 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.75 
 
 		 500 aa  194  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  37.17 
 
 		 453 aa  193  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  43.43 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.94 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  38.17 
 
 		 413 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.27 
 
 		 389 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  36.31 
 
 		 406 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  38.17 
 
 		 413 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.27 
 
 		 475 aa  180  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  37.9 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.78 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  37.9 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  37.63 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.33 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.07 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  37.63 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  37.63 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  36.49 
 
 		 473 aa  178  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  37.63 
 
 		 413 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  40.64 
 
 		 474 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  37.37 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  37.43 
 
 		 404 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.06 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.72 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  38.42 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  36.39 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.12 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  33.67 
 
 		 382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  38.62 
 
 		 411 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.39 
 
 		 435 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.5 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.67 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.17 
 
 		 384 aa  173  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.82 
 
 		 375 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  35.91 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.08 
 
 		 476 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  36.53 
 
 		 442 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.96 
 
 		 459 aa  171  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  41.4 
 
 		 393 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  36.13 
 
 		 535 aa  170  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  36.96 
 
 		 459 aa  170  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  40.07 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.36 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  36.57 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.13 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.43 
 
 		 450 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  35.8 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.13 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.67 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.43 
 
 		 450 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.67 
 
 		 474 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  36.3 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  37.73 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.87 
 
 		 386 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  38.21 
 
 		 396 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.03 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  34.51 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  37.8 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  34.81 
 
 		 393 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.59 
 
 		 525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  37.68 
 
 		 523 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  39.41 
 
 		 388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  36.24 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  34.43 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  36.09 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  36.29 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  35.71 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 350 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36.52 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  34.2 
 
 		 361 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  37.03 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.13 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  37.37 
 
 		 500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.93 
 
 		 476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  36.34 
 
 		 453 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  38.28 
 
 		 498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  37.6 
 
 		 450 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  39.16 
 
 		 394 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  37.6 
 
 		 450 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  35.12 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  37.6 
 
 		 450 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  36.03 
 
 		 383 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  36.03 
 
 		 397 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.04 
 
 		 405 aa  163  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  37.12 
 
 		 450 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.97 
 
 		 401 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.15 
 
 		 472 aa  163  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  36.18 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.54 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.6 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  38.6 
 
 		 401 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.23 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.15 
 
 		 400 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  34.8 
 
 		 402 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>