More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1346 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1346  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 508 aa  1020    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3543  2-alkenal reductase  49.89 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  41.8 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  32.48 
 
 		 453 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  36.58 
 
 		 404 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.82 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.82 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.79 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  35.99 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.13 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.06 
 
 		 474 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  35.75 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  34.38 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  36.57 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  36.75 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  37.04 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  37.04 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  35.06 
 
 		 535 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  37.42 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  36.75 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  36.75 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  36.75 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  36 
 
 		 413 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.63 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  34.35 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.76 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  37.16 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.83 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  39.31 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.15 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.55 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  39.31 
 
 		 406 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  35.16 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  36.4 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  35.16 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.63 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  35.16 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.43 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  35.16 
 
 		 402 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  34.71 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  35.16 
 
 		 388 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  34.2 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  33.01 
 
 		 393 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  35.16 
 
 		 388 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  35.86 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  35.31 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  34.65 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  35.16 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  34 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  35.24 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  34.71 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.39 
 
 		 389 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  35.16 
 
 		 387 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  37.43 
 
 		 361 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  35.16 
 
 		 401 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.16 
 
 		 401 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  34.93 
 
 		 424 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.16 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  38.91 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.89 
 
 		 452 aa  169  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  36.49 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  35.74 
 
 		 383 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.29 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.49 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  34.52 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.3 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  35.54 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  35.69 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.38 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  35.16 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  34.84 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.06 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.74 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.84 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.15 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  34.89 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  36.97 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.84 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  38.38 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.46 
 
 		 472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  38.38 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.44 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  35.15 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  31.11 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  36.76 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  31.19 
 
 		 407 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  35.63 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  38.05 
 
 		 381 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  38.05 
 
 		 391 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  33.41 
 
 		 391 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  36.08 
 
 		 379 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>