More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1696 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  100 
 
 		 481 aa  987    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  38.7 
 
 		 494 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  39.13 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  36.18 
 
 		 463 aa  252  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  35.34 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  31.86 
 
 		 490 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  29.46 
 
 		 485 aa  190  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  29.4 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  32 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  28.34 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  28.18 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  32.74 
 
 		 527 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.33 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  30.25 
 
 		 507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  29.17 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  28.04 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  29.32 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  27.03 
 
 		 566 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  27.81 
 
 		 530 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.03 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  26.86 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  28.07 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  27.64 
 
 		 529 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  28.89 
 
 		 522 aa  90.9  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  26.86 
 
 		 538 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  29.46 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  25.78 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  29.02 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  30.49 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  28.52 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  27.38 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  28.21 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  26.14 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  30.6 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  28.05 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  25.83 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  27.68 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  29.96 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.23 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  30.25 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  27.21 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  27.21 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  26.3 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  28.8 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  26.99 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  27.65 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  26.6 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  26.97 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  26.97 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.5 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  28.07 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  27.95 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  29.96 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.55 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  27.69 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  26.05 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  24.67 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  27.6 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  28.74 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  25.53 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  25.64 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 394 aa  67  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.24 
 
 		 428 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  27.92 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  27.38 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  24 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  24 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  27.49 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.29 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25.86 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.72 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  26.52 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  25.99 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  29.18 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  24.53 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  24.13 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>