114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3009 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  100 
 
 		 527 aa  1068    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  39.89 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  33.23 
 
 		 518 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  32.74 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  27.05 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  31.32 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  27.93 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  31.02 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  27.47 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  27.93 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  30 
 
 		 488 aa  105  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  29.03 
 
 		 530 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  28.76 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  29.02 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  27.39 
 
 		 485 aa  97.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  27.54 
 
 		 440 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  26.48 
 
 		 494 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  29.6 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  28.02 
 
 		 538 aa  93.6  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  25.83 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  27.94 
 
 		 555 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  28.16 
 
 		 529 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  26.63 
 
 		 507 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  27.41 
 
 		 530 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  25.27 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  25.52 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  23.51 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  22.8 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  22.77 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  25.23 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 426 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  23.46 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  22.59 
 
 		 560 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  24.21 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  21.04 
 
 		 544 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  22.15 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  21.96 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  22.14 
 
 		 434 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  23.15 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  26.05 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  26.05 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  24.24 
 
 		 530 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  22.58 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  22.58 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  24.86 
 
 		 950 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  28.29 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  23.94 
 
 		 488 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  21.99 
 
 		 564 aa  47.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 		 566 aa  47  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  22.91 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  23.48 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.92 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  23.47 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4126  peptidase S41  27.98 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  hitchhiker  0.0023076 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  22.71 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  33.08 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  23.35 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  24.72 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  24.72 
 
 		 530 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.81 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  22.36 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  23.08 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  23.08 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  24.52 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  24.72 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  22.12 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  24.72 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 		 530 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  24.72 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  22.32 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  20.68 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  23.46 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  22.75 
 
 		 401 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  22.36 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  20.49 
 
 		 567 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  24.34 
 
 		 515 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  24.85 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 		 513 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  22.78 
 
 		 484 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 469 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 469 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  26.36 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  24.26 
 
 		 526 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 522 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>