70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3287 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  69.85 
 
 		 522 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  100 
 
 		 538 aa  1109    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  62.29 
 
 		 529 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  66.17 
 
 		 533 aa  722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  51.65 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  48.94 
 
 		 555 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  48.43 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  46.34 
 
 		 507 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  42.89 
 
 		 530 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  37.75 
 
 		 566 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  39.04 
 
 		 530 aa  323  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  37.23 
 
 		 440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.5 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  27.49 
 
 		 494 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  29.36 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  25.69 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  30.75 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  26.76 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  28.13 
 
 		 496 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  25.39 
 
 		 494 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  28.02 
 
 		 527 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  26.86 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  26.32 
 
 		 450 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  25.73 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  27.18 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  24.9 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.09 
 
 		 453 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 		 409 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  23.05 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  26.91 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  26.11 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  27.47 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  25.9 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  26.13 
 
 		 560 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  26.69 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  25.71 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  25.82 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  22.73 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  26.87 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  28.97 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  27.86 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  23.36 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  21.36 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  25.27 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 530 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  29.95 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 710 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  26.16 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 507 aa  44.3  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 		 392 aa  44.3  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 		 418 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  24.49 
 
 		 1067 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  23.51 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.43 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>