255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2755 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  100 
 
 		 488 aa  972    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  31.07 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  28.79 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  26.88 
 
 		 566 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  29.01 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  28.31 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  27.48 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  26.54 
 
 		 555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  25.94 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  27.7 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  27.6 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  27.55 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  29.02 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  26.83 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  27.03 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  27.79 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  28.26 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  25.06 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  30.16 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  29.71 
 
 		 527 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  28.84 
 
 		 446 aa  90.5  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  26.59 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  26.87 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  28.49 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  24.03 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  22.22 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  26.2 
 
 		 505 aa  67  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  26.25 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.32 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.84 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  25.77 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  26.87 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  18.43 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.31 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 		 478 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.63 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  24.57 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  24.29 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  22.28 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  23.95 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  21.98 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  21.98 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  21.98 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  27.8 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.9 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  21.98 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  23.92 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  22.79 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  24.3 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  26.07 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  26.67 
 
 		 549 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  21.5 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  25.1 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  21.5 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  23.59 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  23.14 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  26.15 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  22.63 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.98 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  24.9 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  23.59 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  23.39 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  24.75 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 		 401 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 530 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  20.43 
 
 		 478 aa  53.9  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  24.81 
 
 		 526 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.59 
 
 		 401 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  24.09 
 
 		 458 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  26.28 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  22.69 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25.88 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  23.19 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  23.19 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  24.85 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  22.74 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  28.74 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>