71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1719 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  100 
 
 		 460 aa  925    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  39.79 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  32.3 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  31.99 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  32.11 
 
 		 485 aa  186  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  31.08 
 
 		 490 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  32.09 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  30.77 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  28.73 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  29.53 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  27.92 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.2 
 
 		 496 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  28.5 
 
 		 507 aa  96.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  28.89 
 
 		 530 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  26.25 
 
 		 530 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  28.85 
 
 		 566 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  25.82 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  26.32 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  27.18 
 
 		 538 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  26.45 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  27.27 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  25.62 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  24.73 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  25.08 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  26.17 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  24.8 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  29.83 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  24.39 
 
 		 356 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  26.65 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  29.86 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.2 
 
 		 429 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  24.34 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  27.56 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  21.43 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  25.86 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  23.19 
 
 		 535 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 463 aa  47  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  31.91 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  21.05 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  23.95 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  23.25 
 
 		 389 aa  46.6  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  24.11 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  23.02 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  25.94 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  29.27 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  22.98 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  26.58 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  22.78 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  44.26 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  26.69 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  22.45 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.44 
 
 		 389 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  24.82 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  24.02 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  24.24 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  24.02 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  26.94 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>