177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7210 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  100 
 
 		 496 aa  1023    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  39.77 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  30.05 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  28.46 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  28.45 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  27.33 
 
 		 481 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  28.32 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  32.35 
 
 		 492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  27.77 
 
 		 555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  31.73 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  28.88 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  27.14 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  29.02 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  27.25 
 
 		 530 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  30.82 
 
 		 440 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  26.36 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  26.44 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  30.12 
 
 		 485 aa  99.8  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  29.55 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  28.14 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  28.13 
 
 		 538 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  28.24 
 
 		 529 aa  93.6  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  27.77 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  27.46 
 
 		 566 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  25.96 
 
 		 533 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  25.28 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  27.86 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  24.09 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  24.93 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 401 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.64 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 		 569 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.18 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  26.25 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  26.71 
 
 		 526 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  25.91 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  26.71 
 
 		 522 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  26 
 
 		 511 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  23.13 
 
 		 711 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  26.58 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  25.09 
 
 		 445 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  24.04 
 
 		 413 aa  53.9  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 513 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 392 aa  53.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  25.09 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  24.83 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  24.72 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 535 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  24 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  23.83 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  21.12 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  26 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  27.31 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 550 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 530 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  26 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  25.84 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  30.6 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  25.64 
 
 		 530 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 		 550 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.59 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 524 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 530 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  25.64 
 
 		 524 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  25.64 
 
 		 524 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  25.64 
 
 		 524 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  25.64 
 
 		 524 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  24.73 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  26.01 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  20.22 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  30.95 
 
 		 356 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 421 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  22.3 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  27.11 
 
 		 549 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.72 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  23.99 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  31.1 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.49 
 
 		 710 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.58 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>