More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1888 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  100 
 
 		 494 aa  1002    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  57.82 
 
 		 494 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  45.18 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  39.31 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  36.65 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  34.15 
 
 		 490 aa  227  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  32.78 
 
 		 485 aa  209  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  31.98 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  33.97 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  31.83 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  30.18 
 
 		 566 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  28.42 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  30.64 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  26.53 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  32.26 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.05 
 
 		 527 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  32.21 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  28.06 
 
 		 471 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  28.09 
 
 		 507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  29.14 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  30.99 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  31.16 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  28.94 
 
 		 530 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  28.75 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  28.82 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  27.7 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  31.12 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  28.91 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  27.68 
 
 		 554 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  28.51 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  26.02 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  23.99 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  27 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.87 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  25.37 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.87 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  26.63 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  25.58 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  26.98 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  27.3 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  27.3 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  26.94 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  27.36 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.11 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  24.45 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  24.34 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.62 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  24.69 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  26.83 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.66 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  28.86 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.8 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  24.54 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.8 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.45 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.65 
 
 		 710 aa  60.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  28.81 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  26.99 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.62 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  28 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  25.62 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  28.25 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  26.62 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  23.24 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  23.12 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  25.82 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  24.63 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  23.66 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  23.12 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  23.44 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  23.53 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  25.82 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>