160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4634 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  65.73 
 
 		 529 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  71.67 
 
 		 522 aa  771    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  69.77 
 
 		 538 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  100 
 
 		 533 aa  1092    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  55.71 
 
 		 530 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  50.87 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  49.23 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  48.74 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  40.04 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  40.53 
 
 		 530 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  41.45 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  37.9 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  29.23 
 
 		 494 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  27.52 
 
 		 490 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  29.19 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  29.32 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  26.91 
 
 		 488 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  27.09 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  30.42 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  26.86 
 
 		 481 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  26.02 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  25.96 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  26.12 
 
 		 450 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  25.54 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  24.83 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  25.52 
 
 		 527 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  24.93 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  27.97 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.94 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.36 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  26.45 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  27.72 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.97 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  26.82 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.81 
 
 		 401 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  26.86 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  26.98 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  23.74 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.14 
 
 		 429 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.44 
 
 		 475 aa  53.9  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 423 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 402 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.09 
 
 		 431 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  27.96 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 		 417 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  24.91 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  29.34 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  24.73 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  29.07 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  27.54 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  25.14 
 
 		 402 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 401 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  25.95 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  22.43 
 
 		 552 aa  50.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.37 
 
 		 409 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  26.35 
 
 		 582 aa  50.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  29.47 
 
 		 446 aa  50.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  31.33 
 
 		 449 aa  50.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  26.85 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  25.14 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  25 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  23.53 
 
 		 401 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  30.36 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  29.05 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  21.65 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  29.05 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  26.24 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  29.2 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  21.74 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.75 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  24.52 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  20.92 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  27.65 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  30 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>