More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5878 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  100 
 
 		 494 aa  1003    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  57.82 
 
 		 494 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  46.39 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  39.91 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  33.49 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  34.48 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  33.69 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  31.73 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  29.55 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  30.07 
 
 		 406 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  31.29 
 
 		 507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  30.89 
 
 		 533 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  28.71 
 
 		 566 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  27.64 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  29.21 
 
 		 440 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  29.23 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  28.83 
 
 		 530 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  29.5 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  27.39 
 
 		 555 aa  113  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.76 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  28.21 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  25.41 
 
 		 527 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  26.92 
 
 		 538 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  29.23 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  26.58 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  25.58 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  26.96 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.67 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 440 aa  67  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  24 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  24.74 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  28.4 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  23.88 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  22.15 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  25.94 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  24.75 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  23.88 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  22.15 
 
 		 424 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  24.49 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  23.49 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.33 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  23.22 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  24.7 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  27.67 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  22.73 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  24.49 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  25.29 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  22.73 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  26.19 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  23.8 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  27.36 
 
 		 456 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  25.89 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  21.88 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  22.37 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.53 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  22.68 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  23 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.11 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  22.4 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.46 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  27.52 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  27.52 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  25.73 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  26.69 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  28.12 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  30.57 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  26.1 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  23.96 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  23.38 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  25.51 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>