241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2144 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  100 
 
 		 492 aa  1008    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  46.99 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  42.89 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  36.65 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  34.48 
 
 		 494 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  35.34 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  35.48 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  33.51 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  32.26 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  29.56 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  29.03 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  31.22 
 
 		 530 aa  127  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  28.15 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  29.24 
 
 		 518 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  28.54 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  28.51 
 
 		 522 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  32.46 
 
 		 496 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 		 530 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  28.32 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  30.48 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  28.42 
 
 		 538 aa  113  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  30.51 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  25.84 
 
 		 507 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  28.72 
 
 		 529 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.38 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.25 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  25.56 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  24.55 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.05 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  21.95 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  29.46 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  25.24 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.8 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  25.9 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.8 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  24.23 
 
 		 482 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  24.19 
 
 		 389 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  25.42 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  25.53 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  28.7 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  28.47 
 
 		 521 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  29.35 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  25.21 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  27.89 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  27.89 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  27.89 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  27.89 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  27.89 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.59 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  27.88 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  22.84 
 
 		 505 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  23.48 
 
 		 544 aa  53.9  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  22.93 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  22.95 
 
 		 440 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 429 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 418 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  23.63 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.9 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  24.07 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 555 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 		 674 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  25.91 
 
 		 572 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.6 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  24.14 
 
 		 665 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  21.41 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  26.02 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  23.81 
 
 		 680 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  24.58 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  21.6 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  25.83 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  25.38 
 
 		 664 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 401 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  24.09 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  26.37 
 
 		 526 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  26.2 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  26.84 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  24.36 
 
 		 356 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  23.95 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>