137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1456 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  100 
 
 		 518 aa  1048    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  31.24 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  28.94 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  34.13 
 
 		 527 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  26.53 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  29.53 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  29.24 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  27.64 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.6 
 
 		 488 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  31.56 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  27.25 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  27.97 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  28.03 
 
 		 530 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  28.74 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.3 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  27.34 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  30.43 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  29.04 
 
 		 485 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  26.65 
 
 		 566 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  26.37 
 
 		 507 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  26.64 
 
 		 555 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  26.02 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  25.37 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  26.1 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  25.73 
 
 		 538 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  26.88 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  28.63 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  25.18 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  23.77 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  21.69 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  22.74 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  26.13 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  23.36 
 
 		 401 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.23 
 
 		 472 aa  53.5  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 557 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  24.3 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  21.91 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  29.76 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  29.76 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  27.31 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.25 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  23.87 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  30.89 
 
 		 484 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 		 453 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 409 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.62 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  24.28 
 
 		 551 aa  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.36 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  23.41 
 
 		 478 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  23.23 
 
 		 383 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  25.77 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  24.15 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  25.38 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  24.69 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  22.85 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  23.92 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  22.41 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  23.24 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  24.34 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  23.51 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  23.36 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  24.58 
 
 		 549 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  22.01 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.48 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  22.57 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  22.61 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 377 aa  47.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 535 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 556 aa  47  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  24.54 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  20.66 
 
 		 428 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  32.43 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  22.7 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  23.02 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>