94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1752 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1091    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  53.22 
 
 		 533 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  50.84 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  52.95 
 
 		 522 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  52.24 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  51.65 
 
 		 538 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  51.55 
 
 		 507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  48.86 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  50 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  42.61 
 
 		 566 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  41.48 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  37.44 
 
 		 440 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  28.54 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  31.02 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  28.67 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  32.21 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  28.61 
 
 		 490 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  27.85 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.25 
 
 		 496 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  27.51 
 
 		 481 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  30.69 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  29.03 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  29.19 
 
 		 406 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  28.51 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  27.51 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  25.41 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  30.36 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.6 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.57 
 
 		 401 aa  53.9  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  24.63 
 
 		 560 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  23.28 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  23.28 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  25.95 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  27.36 
 
 		 429 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  30.63 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  28.64 
 
 		 402 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.41 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  27.01 
 
 		 429 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  26.84 
 
 		 550 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.58 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.64 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  23.92 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  22.78 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  29.56 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.64 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  27.7 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  23.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  23.6 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  27.72 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  27.27 
 
 		 476 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 		 575 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  27.15 
 
 		 401 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 526 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 491 aa  47  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  23.93 
 
 		 551 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.28 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  26.22 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.29 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.54 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  25.18 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1658  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  28.24 
 
 		 719 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305852  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  29.81 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  22.52 
 
 		 528 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 402 aa  45.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 402 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  27.9 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  23.77 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  27.54 
 
 		 394 aa  44.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  24.88 
 
 		 402 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  28.05 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 438 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 431 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  31.88 
 
 		 556 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.81 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  25 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  22.59 
 
 		 484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.02 
 
 		 397 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 567 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>