More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3853 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  100 
 
 		 450 aa  926    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  33.85 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  32.13 
 
 		 460 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  31.83 
 
 		 494 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  29.55 
 
 		 494 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  29.5 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  30.13 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  28.5 
 
 		 481 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  28.63 
 
 		 490 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  28.04 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  31.56 
 
 		 518 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  30.6 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  28.29 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.93 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  27.92 
 
 		 530 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  27.98 
 
 		 529 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  26.76 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  29.56 
 
 		 507 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  25.45 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  23.83 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  27.17 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  26.32 
 
 		 538 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  25.41 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  28.7 
 
 		 897 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  24.71 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.53 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  22.22 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  26.71 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  25 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  32.9 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  25.47 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.31 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  24.46 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  22.52 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  27.9 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  25.33 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 550 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  31.01 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  25.42 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  30.13 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.42 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  29.81 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  22.53 
 
 		 557 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  23.31 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  24.21 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  25.82 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  26.41 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  24.89 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  25.74 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.08 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.21 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  25.11 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  22.7 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25.38 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  20.76 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  25.86 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  24.83 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  25.38 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.3 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  22.58 
 
 		 535 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  24.24 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  23.36 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  23.48 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  23.78 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  26.76 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  23.82 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>