70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3023 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  100 
 
 		 440 aa  897    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  38.81 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  37.9 
 
 		 533 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  39.95 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  40.66 
 
 		 530 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  38.26 
 
 		 522 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  36.53 
 
 		 538 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  35.54 
 
 		 555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  37.44 
 
 		 530 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  33.26 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  32.46 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  31.94 
 
 		 530 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  31.13 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  29.33 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  31.29 
 
 		 494 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  29.32 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.27 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  27.27 
 
 		 492 aa  109  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  30.82 
 
 		 496 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  29.11 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  27.85 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  25.8 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  28.48 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.54 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  26.45 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  25.11 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  23.17 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  26.3 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  26.26 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.81 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  24.87 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  24.79 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  29.2 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  22.75 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  22.75 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  22.03 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  22.83 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.82 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  25.49 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 554 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.77 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  28.1 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.13 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  25.56 
 
 		 551 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  22.87 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 575 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.51 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  23.03 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  30.23 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.62 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 		 710 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  24.89 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  25.2 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>