203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0479 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  100 
 
 		 471 aa  971    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  51.77 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  49.23 
 
 		 533 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  48.86 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  47.74 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  51.06 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  48.43 
 
 		 538 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  45.96 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  44.08 
 
 		 566 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  44.11 
 
 		 530 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  43.12 
 
 		 530 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  33.26 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  26.42 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  31.09 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  26.36 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  26.9 
 
 		 488 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.29 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  30.26 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  28.07 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  26.26 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  25.37 
 
 		 518 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.46 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  25.45 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  26.93 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  26.27 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  32.63 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.06 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  32.63 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  31.58 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  25.7 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  24.8 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  32.03 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.2 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  31.05 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  24 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  24.22 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  26.58 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  27 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  27 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.8 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  26.12 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.53 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  28.8 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  28.92 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.64 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 		 710 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  29.47 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  24.45 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  29.47 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 1081 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  25.35 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 550 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  27.72 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  27.54 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  22.56 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  27.57 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 555 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.89 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  26.37 
 
 		 457 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 557 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  20.78 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  28.4 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  28.05 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  24.19 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  25.84 
 
 		 496 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  25.84 
 
 		 496 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  30.22 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  28.49 
 
 		 398 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  23.46 
 
 		 551 aa  53.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 544 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  30 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  21.45 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  24.28 
 
 		 842 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  22.81 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.36 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.99 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.14 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  23.43 
 
 		 572 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  22.55 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  24.06 
 
 		 1072 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>