160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02497 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  63.77 
 
 		 530 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1168    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  49.67 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  42.98 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  42.55 
 
 		 530 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  40.2 
 
 		 533 aa  359  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  39.07 
 
 		 529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  41.05 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  38.85 
 
 		 507 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  40.09 
 
 		 538 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  37.55 
 
 		 530 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  32.63 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  28.4 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  27.44 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  28.63 
 
 		 494 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  28.29 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  30.3 
 
 		 485 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  27.12 
 
 		 494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  27.23 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  28.25 
 
 		 450 aa  107  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  26.49 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  25.77 
 
 		 518 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  28.85 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.46 
 
 		 496 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  24.93 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  23.02 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.86 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.39 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  24.52 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  23.49 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  24.58 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  24.22 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  22.44 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  23.95 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 550 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.96 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  22.45 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  24.82 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  24.35 
 
 		 540 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  22.74 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 418 aa  54.7  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 449 aa  54.3  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  25.96 
 
 		 457 aa  54.7  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 423 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  23.46 
 
 		 401 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  23.62 
 
 		 413 aa  54.3  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  23.17 
 
 		 582 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 560 aa  54.3  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 429 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 429 aa  53.9  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  25.1 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  22.57 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.65 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 		 442 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  23.81 
 
 		 497 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  24.38 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  22.35 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.14 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  22.89 
 
 		 505 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  26.59 
 
 		 575 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  22.9 
 
 		 401 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  25.11 
 
 		 401 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  25.35 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  24.24 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  24.47 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 438 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.99 
 
 		 397 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  24.9 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  26.45 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  28.31 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 427 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  20.94 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  24.6 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 438 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  22.99 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  25.11 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  22.61 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  21.92 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  25.42 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 394 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>