121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0151 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  100 
 
 		 530 aa  1074    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  51.77 
 
 		 507 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  50 
 
 		 530 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  43.98 
 
 		 555 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  43.12 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  39.29 
 
 		 529 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  41.72 
 
 		 533 aa  346  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  43.11 
 
 		 522 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  42.89 
 
 		 538 aa  339  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  35.96 
 
 		 566 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  40.66 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  29.12 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  30.85 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  28.05 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  27.05 
 
 		 490 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  29.95 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  31.9 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  26.83 
 
 		 494 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  27.93 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  24.65 
 
 		 463 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  28.32 
 
 		 527 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  28.03 
 
 		 518 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  26.25 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  27.71 
 
 		 406 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  23.25 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  26.43 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 434 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  24.74 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  23.82 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  23.82 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  24.21 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  24.47 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  30.53 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  25.33 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  24.04 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  27.72 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  24.85 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  23.53 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  24.3 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 		 401 aa  54.3  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  23.63 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  33.33 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  24.03 
 
 		 544 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  24.29 
 
 		 551 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 484 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 547 aa  50.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  26.61 
 
 		 426 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  24.28 
 
 		 416 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  25.26 
 
 		 528 aa  50.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  25.54 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  22.3 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  26.72 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  24.03 
 
 		 556 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  28.8 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  22.3 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  28.28 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  25.11 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 		 496 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 		 496 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 		 710 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 397 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 552 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  29.29 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  22.92 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  24.61 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  24.92 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  28.1 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  24.7 
 
 		 1081 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  23.45 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  22.75 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.44 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  31.74 
 
 		 534 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  23.02 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.53 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  23.75 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  24.58 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0718  peptidase S41  26.26 
 
 		 564 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 401 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.33 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>