176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7089 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7089  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1117    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
601 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
602 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
740 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 
592 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
502 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.14 
 
 
502 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
502 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
578 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.47 
 
 
1077 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
653 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.65 
 
 
653 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
574 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.16 
 
 
648 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
520 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
3145 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  30.19 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
523 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
767 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.76 
 
 
503 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
607 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
556 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
1212 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 
595 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
1034 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  33.44 
 
 
360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
1005 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
607 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  33.53 
 
 
387 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
747 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 
714 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
955 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  28.24 
 
 
703 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
1038 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.28 
 
 
550 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
406 aa  137  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.83 
 
 
615 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29.79 
 
 
630 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 
604 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
935 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
1451 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
1454 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
611 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
760 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
649 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
649 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.59 
 
 
603 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.7 
 
 
626 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
646 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  33.76 
 
 
389 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
688 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
529 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 
689 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
636 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
1073 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
747 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
1450 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.93 
 
 
1677 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
1827 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
505 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
412 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  28.33 
 
 
546 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
714 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
487 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.77 
 
 
620 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.61 
 
 
626 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.29 
 
 
872 aa  123  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.02 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.64 
 
 
626 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.64 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.64 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
438 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
614 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
620 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
637 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
636 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
527 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  30.38 
 
 
385 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
612 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
635 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
635 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
662 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.01 
 
 
530 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
611 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
571 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
637 aa  114  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>