More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1767 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
228 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  81.06 
 
 
279 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  83.7 
 
 
261 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  78.95 
 
 
256 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  76 
 
 
275 aa  357  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  75.56 
 
 
286 aa  355  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  73.42 
 
 
261 aa  341  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  76.55 
 
 
260 aa  341  5e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  72.07 
 
 
271 aa  338  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.12 
 
 
269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  72.37 
 
 
262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  77.48 
 
 
276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.48 
 
 
264 aa  327  8e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  74.45 
 
 
269 aa  325  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.47 
 
 
271 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.11 
 
 
264 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  68.75 
 
 
299 aa  315  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  76.13 
 
 
250 aa  314  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.85 
 
 
259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  69.47 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  72.12 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.36 
 
 
287 aa  311  5.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.17 
 
 
296 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.24 
 
 
282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  63.72 
 
 
288 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  68.14 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  74.22 
 
 
273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  69.3 
 
 
270 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  67.98 
 
 
260 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.32 
 
 
298 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.32 
 
 
298 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  64.41 
 
 
231 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.86 
 
 
298 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  63.51 
 
 
230 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.78 
 
 
264 aa  286  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  68.61 
 
 
333 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.11 
 
 
262 aa  278  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.92 
 
 
265 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  58.74 
 
 
241 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.6 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.58 
 
 
252 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.68 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.13 
 
 
252 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.13 
 
 
252 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.04 
 
 
252 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.68 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.89 
 
 
233 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
254 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.68 
 
 
264 aa  205  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
564 aa  205  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.45 
 
 
237 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.2 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.77 
 
 
257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.89 
 
 
240 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.35 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.37 
 
 
245 aa  195  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.24 
 
 
249 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  48.87 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.91 
 
 
238 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.36 
 
 
256 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  48.87 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 
243 aa  193  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
248 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  45.25 
 
 
256 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.69 
 
 
249 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.36 
 
 
238 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
254 aa  191  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
254 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  45.25 
 
 
247 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.25 
 
 
233 aa  191  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  41.36 
 
 
268 aa  191  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  44.34 
 
 
247 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.42 
 
 
259 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  45.91 
 
 
254 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
266 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.64 
 
 
247 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  46.82 
 
 
261 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 
239 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 
267 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
255 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.18 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.55 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.55 
 
 
249 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
258 aa  189  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
254 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.63 
 
 
252 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
255 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
255 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 
252 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  49.32 
 
 
267 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  43.44 
 
 
257 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  49.32 
 
 
259 aa  184  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  39.55 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  42.53 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.72 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  41.36 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>