More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1385 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
233 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  95.71 
 
 
233 aa  433  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
231 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  54.19 
 
 
231 aa  259  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 
239 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.61 
 
 
264 aa  255  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  51.95 
 
 
240 aa  254  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  53.45 
 
 
248 aa  254  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  53.71 
 
 
245 aa  254  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.09 
 
 
252 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
248 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
251 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.17 
 
 
252 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
238 aa  244  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
252 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.54 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  52.65 
 
 
225 aa  242  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
257 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
247 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
249 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.65 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.34 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
249 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
286 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
261 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
249 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
234 aa  234  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
259 aa  233  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.28 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.12 
 
 
279 aa  232  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  231  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  44.7 
 
 
289 aa  231  8.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
271 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.72 
 
 
259 aa  230  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.29 
 
 
269 aa  230  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
252 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.35 
 
 
249 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.02 
 
 
244 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
241 aa  229  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
244 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.7 
 
 
260 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
275 aa  228  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
265 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
241 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
261 aa  227  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
259 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.41 
 
 
264 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.19 
 
 
259 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
259 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
264 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.14 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.21 
 
 
269 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
251 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.98 
 
 
245 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
258 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  46.02 
 
 
248 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
254 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
248 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.7 
 
 
243 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
254 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.03 
 
 
271 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
236 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
232 aa  225  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
254 aa  225  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1975  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.46 
 
 
258 aa  225  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.100938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
236 aa  225  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
240 aa  224  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
246 aa  224  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
245 aa  224  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
258 aa  224  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>