More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4435 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.85 
 
 
252 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  64.54 
 
 
266 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  68.97 
 
 
259 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  68.51 
 
 
252 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  68.97 
 
 
259 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.8 
 
 
251 aa  329  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.63 
 
 
252 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.53 
 
 
252 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.67 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  67.09 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  69.66 
 
 
259 aa  321  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.09 
 
 
252 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  62.92 
 
 
247 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.58 
 
 
252 aa  313  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  61.51 
 
 
247 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  64.68 
 
 
257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.19 
 
 
255 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.9 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.76 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.76 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.91 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  65.11 
 
 
267 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  58.61 
 
 
254 aa  293  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.07 
 
 
244 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
248 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  54.08 
 
 
254 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
261 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.48 
 
 
247 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
252 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  51.28 
 
 
236 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.95 
 
 
257 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
240 aa  245  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.64 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.69 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
247 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
244 aa  242  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
258 aa  242  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
236 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.64 
 
 
257 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
241 aa  241  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.64 
 
 
258 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
246 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
234 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
266 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
246 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.1 
 
 
249 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.41 
 
 
257 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
249 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.98 
 
 
243 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
249 aa  239  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.52 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.65 
 
 
236 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.55 
 
 
267 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
256 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 
249 aa  238  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.55 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.28 
 
 
267 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
258 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
263 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.48 
 
 
252 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.37 
 
 
254 aa  236  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
256 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
246 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
245 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.25 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.74 
 
 
259 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
251 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.86 
 
 
256 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.86 
 
 
256 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  43.51 
 
 
256 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
282 aa  230  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
275 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
256 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
246 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.83 
 
 
251 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.3 
 
 
282 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
251 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.29 
 
 
250 aa  229  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
247 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.83 
 
 
247 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1923  undecaprenyl diphosphate synthase  55 
 
 
234 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
248 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
256 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
260 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>