More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2707 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  88.16 
 
 
245 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3995  undecaprenyl diphosphate synthase  71.07 
 
 
244 aa  329  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.699417  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  62.98 
 
 
243 aa  304  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.11 
 
 
241 aa  292  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.67 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  50.41 
 
 
266 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
247 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.62 
 
 
244 aa  238  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.1 
 
 
237 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.38 
 
 
251 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  51.98 
 
 
257 aa  235  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  52 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
259 aa  234  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
259 aa  234  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.9 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 
252 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.76 
 
 
252 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
252 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
255 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  228  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
252 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  228  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
255 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
252 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 
252 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
248 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
248 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
251 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.3 
 
 
248 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
246 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.16 
 
 
267 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
238 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
260 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
253 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
253 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
234 aa  222  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
251 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
240 aa  221  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
238 aa  221  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  48.75 
 
 
260 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  51.54 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.93 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.33 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.21 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
260 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
260 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
260 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
256 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
260 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
260 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
252 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.88 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
264 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
236 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
259 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.35 
 
 
266 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  46.69 
 
 
251 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
260 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
265 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
267 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.98 
 
 
259 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.89 
 
 
256 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
241 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
247 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.56 
 
 
257 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
260 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.68 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
246 aa  215  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.02 
 
 
282 aa  215  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.12 
 
 
260 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.33 
 
 
249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.81 
 
 
252 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.35 
 
 
285 aa  214  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  45.3 
 
 
244 aa  214  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.02 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.98 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>