More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2045 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  93.05 
 
 
259 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  93.05 
 
 
259 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  74.09 
 
 
257 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  67.87 
 
 
255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  73.88 
 
 
267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.35 
 
 
252 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.14 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  65.52 
 
 
266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  64.1 
 
 
247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.15 
 
 
252 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  63.68 
 
 
247 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.9 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.1 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.75 
 
 
252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.35 
 
 
252 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.22 
 
 
252 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  63.76 
 
 
254 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.83 
 
 
248 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.57 
 
 
254 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.57 
 
 
254 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  60 
 
 
260 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.4 
 
 
255 aa  284  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.66 
 
 
237 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.41 
 
 
244 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.2 
 
 
245 aa  258  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.7 
 
 
261 aa  245  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  51.95 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  54.87 
 
 
254 aa  244  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.9 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  54.39 
 
 
254 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.68 
 
 
246 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  51.74 
 
 
253 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
248 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
259 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
234 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 
312 aa  239  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.61 
 
 
257 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49 
 
 
256 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
256 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.08 
 
 
243 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  53.74 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 
244 aa  238  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
256 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
256 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
251 aa  237  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
266 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
253 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
253 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
263 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
249 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
249 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.79 
 
 
252 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
249 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  51.65 
 
 
275 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.04 
 
 
259 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
243 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.56 
 
 
236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.26 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.24 
 
 
267 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
251 aa  235  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.95 
 
 
282 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
251 aa  234  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  48.16 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.35 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
249 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
276 aa  232  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
247 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.42 
 
 
247 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.65 
 
 
256 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.96 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
262 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.26 
 
 
257 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
249 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  53.91 
 
 
228 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
253 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
236 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
251 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  47.84 
 
 
256 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 
254 aa  228  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.86 
 
 
252 aa  228  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
233 aa  228  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
256 aa  228  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
252 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
267 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 
267 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
272 aa  228  9e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
248 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
249 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
241 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>