More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0299 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  69.14 
 
 
260 aa  353  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  64.54 
 
 
255 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  68.24 
 
 
252 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.09 
 
 
252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.38 
 
 
252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.09 
 
 
251 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.71 
 
 
252 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.09 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.19 
 
 
252 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.78 
 
 
237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  67.67 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  68.64 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  65.22 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  65.22 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.38 
 
 
255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  62.93 
 
 
247 aa  304  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.94 
 
 
254 aa  304  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.5 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  62.07 
 
 
247 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  65.52 
 
 
259 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  61.57 
 
 
254 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.37 
 
 
252 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.65 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.39 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  55.56 
 
 
254 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.08 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.23 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.73 
 
 
267 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.64 
 
 
238 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
248 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
234 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.61 
 
 
249 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  54.39 
 
 
254 aa  248  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
249 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
241 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.16 
 
 
245 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
259 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 
248 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
243 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.38 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.21 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.19 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.16 
 
 
246 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
249 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.41 
 
 
247 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
251 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  50.41 
 
 
247 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
244 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
252 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.44 
 
 
267 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.61 
 
 
282 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.07 
 
 
253 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.07 
 
 
253 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.93 
 
 
252 aa  237  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
276 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  51.69 
 
 
259 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
240 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
289 aa  236  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
276 aa  236  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.27 
 
 
249 aa  235  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.37 
 
 
257 aa  234  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
266 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
236 aa  234  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
246 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.18 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.63 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
241 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.72 
 
 
285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
261 aa  232  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.96 
 
 
265 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.26 
 
 
256 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  50.41 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  45.42 
 
 
272 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  53.74 
 
 
228 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
246 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
261 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.85 
 
 
257 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
266 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  42.51 
 
 
291 aa  228  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
249 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.24 
 
 
259 aa  228  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
256 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
251 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
253 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.39 
 
 
256 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 
263 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.69 
 
 
257 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.14 
 
 
256 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>