More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2520 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
248 aa  500  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  71.43 
 
 
247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  71.01 
 
 
247 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.76 
 
 
252 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.4 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.98 
 
 
254 aa  318  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.5 
 
 
255 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  59.91 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.26 
 
 
237 aa  301  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.83 
 
 
252 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.43 
 
 
252 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  61.44 
 
 
257 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.3 
 
 
252 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.72 
 
 
252 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  57.32 
 
 
254 aa  291  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.58 
 
 
252 aa  290  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  61.7 
 
 
267 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.77 
 
 
252 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  58.62 
 
 
259 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  58.62 
 
 
259 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  56.3 
 
 
260 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  56.65 
 
 
266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  59.83 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.71 
 
 
245 aa  261  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.42 
 
 
244 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
253 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
253 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.58 
 
 
257 aa  248  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
261 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
233 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.73 
 
 
249 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.19 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 
248 aa  241  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
246 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
264 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.57 
 
 
252 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.1 
 
 
236 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
263 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
257 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.7 
 
 
247 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
257 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.72 
 
 
286 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
251 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.06 
 
 
257 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.64 
 
 
252 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
258 aa  234  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
233 aa  233  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
266 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
282 aa  231  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.58 
 
 
256 aa  231  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  51.11 
 
 
254 aa  231  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.98 
 
 
251 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
264 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
228 aa  229  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
271 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
258 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
256 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
275 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.38 
 
 
270 aa  228  5e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
236 aa  228  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.19 
 
 
249 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
238 aa  228  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
236 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
275 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
275 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
275 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
240 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
251 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
246 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  48.57 
 
 
258 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
254 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
251 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.48 
 
 
252 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
259 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.85 
 
 
266 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
236 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
275 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  47.16 
 
 
264 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
256 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  42.74 
 
 
251 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.99 
 
 
249 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>