More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0690 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
270 aa  566  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.23 
 
 
257 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.23 
 
 
259 aa  300  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.94 
 
 
258 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.79 
 
 
258 aa  291  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.56 
 
 
258 aa  291  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.56 
 
 
258 aa  291  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.56 
 
 
254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  288  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
257 aa  288  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0805  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.98 
 
 
239 aa  287  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655328  hitchhiker  0.0000000226437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.15 
 
 
258 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.15 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.56 
 
 
256 aa  281  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.56 
 
 
256 aa  281  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.78 
 
 
249 aa  281  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.69 
 
 
256 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.81 
 
 
253 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.81 
 
 
253 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.02 
 
 
249 aa  255  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.77 
 
 
247 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
254 aa  248  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.77 
 
 
251 aa  245  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
248 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 
251 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.5 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.77 
 
 
257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2435  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.26 
 
 
244 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000170517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  47.9 
 
 
244 aa  242  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.6 
 
 
259 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
240 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
263 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.46 
 
 
246 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
251 aa  239  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.37 
 
 
256 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  46.94 
 
 
253 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.53 
 
 
245 aa  235  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
247 aa  234  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.45 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 
267 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.45 
 
 
249 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  45.42 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.86 
 
 
251 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.23 
 
 
249 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.09 
 
 
257 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
246 aa  229  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.03 
 
 
252 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.94 
 
 
267 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.96 
 
 
249 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
249 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
251 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 
256 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
248 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.4 
 
 
267 aa  228  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 
246 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
260 aa  228  7e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
254 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.8 
 
 
249 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
240 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
253 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.27 
 
 
246 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  44.13 
 
 
260 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.66 
 
 
275 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.66 
 
 
275 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
238 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
247 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
265 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.46 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 
275 aa  224  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.27 
 
 
275 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
250 aa  224  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
238 aa  224  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
271 aa  224  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  44.17 
 
 
252 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
273 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.83 
 
 
267 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
240 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.3 
 
 
285 aa  222  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.49 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
252 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.58 
 
 
256 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.09 
 
 
266 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.64 
 
 
266 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.58 
 
 
256 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.46 
 
 
246 aa  221  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.4 
 
 
251 aa  221  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  43.15 
 
 
246 aa  221  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>