More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1431 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  95.71 
 
 
233 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  55.84 
 
 
245 aa  265  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  54.35 
 
 
239 aa  264  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  55.07 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
231 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 
264 aa  258  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  53.02 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
252 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
252 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
240 aa  248  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
259 aa  246  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
238 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
252 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
252 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
251 aa  244  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  53.1 
 
 
225 aa  244  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.23 
 
 
222 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
249 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.52 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
247 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.72 
 
 
247 aa  240  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
259 aa  239  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
247 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.38 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
263 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
234 aa  238  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  45.08 
 
 
289 aa  237  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
228 aa  237  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
261 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
260 aa  234  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
258 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
241 aa  234  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
286 aa  234  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  47.19 
 
 
232 aa  234  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.14 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.35 
 
 
249 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
259 aa  233  3e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
241 aa  231  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
260 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
260 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
257 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
251 aa  230  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
265 aa  230  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.88 
 
 
250 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.83 
 
 
260 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
236 aa  229  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.96 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.9 
 
 
244 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
279 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.74 
 
 
269 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
248 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.93 
 
 
267 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.84 
 
 
257 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
244 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
260 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
271 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
257 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.47 
 
 
269 aa  228  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
246 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
253 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
259 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
236 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
276 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
236 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
245 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
259 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
248 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>